隨著現代生物醫學研究技術的逐步深入和高通量測序技術的不斷精進，高通量單細胞測序技術也順應而生，并在生物醫學研究的多個領域得到廣泛應用。高通量單細胞測序技術主要通過定量研究單細胞內的mRNA轉錄組、蛋白表達譜、抗體VDJ組合信息以及染色質可及性等多方面信息，綜合展示單細胞水平上的細胞異質性。
隨著單細胞技術的發展，越來越多病毒研究領域的學者，嘗試用高通量單細胞測序這個新式武器，針對隱匿在細胞中的病毒一探究竟。但考慮到病毒普遍具備以下幾個特點：
1）有明確的宿主細胞特異性，即同一組織內僅感染特定的細胞類型；
2）體內環境下，病毒陽性感染的細胞比例極低；
3）相對于宿主細胞，單個細胞內的病毒mRNA分子數很少。
這導致利用常規的高通量單細胞測序分析方法，很難直接檢測到某個細胞內痕量的病毒mRNA分子。
為了解決這一問題，中科普瑞單細胞技術平臺收集建立了一個包含多達10000余種病毒基因組序列信息的病毒信息數據庫，并搭建了一套適用于多平臺（BD或10X）的單細胞病毒轉錄組分析流程。利用病毒數據庫+病毒分析流程，得以從單細胞轉錄組的角度，研究病毒和宿主細胞的相互作用。
應用范圍
通過單細胞病毒轉錄組分析，我們在單細胞水平研究：
2當前組織中感染了哪（些）類病毒；
2哪些細胞類型是病毒的宿主細胞，易感細胞具有什么特征表達譜；
2病毒在宿主細胞內表達了哪些轉錄本，豐度如何；
2在病毒感染前后，宿主細胞轉錄組發生哪些相應的改變。
結果展示
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