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Illumina NovaSeq 6000 測序平臺

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每個流動槽的序列產出

 NovaSeq 5000與6000系統NovaSeq 6000系統
流動槽類型eS1*S2S3*S4*
2 x 50 bp高達167 Gb280–333 GbNA**NA**
2 × 100 bp高達333 Gb560–667 GbNA**NA**
2 × 150 bp高達500 Gb850–1000 Gb高達2000 Gb高達3000 Gb

參數基于Illumina PhiX 標準文庫支持簇密度下數據產出的情況。

* The NovaSeq 5000系統,NovaSeq 5000系統Upgrade以及包含 S1,S3或S4流動槽的NovaSeq Reagent Kits將會在2017年提供。

** NA: not applicable

Reads Passing Filter

 NovaSeq 5000與6000系統NovaSeq 6000系統
流動槽類型S1*S2S3*S4*
 高達1.6 B2.8–3.3 B高達6.6 B高達10 B

質量分值? 與運行時間??

 NovaSeq 6000系統
流動槽類型S2
Read長度2 x 50 bp2 × 100 bp2 × 150 bp
質量分值 (percent of bases above Q30)≥ 85 %≥ 80 %≥ 75 %
運行時間19 小時29 小時40 小時

? 質量分值 (Q-score) 是對堿基檢出中錯誤發生幾率的預測。 bases > Q30 的百分比為整個運行中數據的平均值。

?? 運行時間包括在NovaSeq 6000系統上進行簇生成、測序以及運行雙S2流動槽進行堿基讀取的時間。

對關鍵應用估計的樣品通量???

 NovaSeq 5000與6000系統NovaSeq 6000系統
流動槽類型S1*S2S3*S4*
每次運行的人類基因組數n多達8個多達16個多達32個多達48個
每次運行的外顯子數多達66個多達132個

每次運行的轉錄組數多達66個多達132個

??? 所有的樣品通量是基于雙流動槽運行的估計值。人類基因組假設每個樣品能夠生成 > 120 Gb的數據,從而實現30x的基因組覆蓋度。外顯子假設以 ≥ 2 x 75 bp生成 ≥ 50M的reads。轉錄組假設以 ≥ 2 x 50 bp生成 ≥ 50M的reads。


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