10x Genomics具有通量高、靈活性強、流程簡單、技術性能高、單個細胞制備成本低等優勢，其技術核心是油滴包裹的凝膠珠（GEM），該系統有75萬種barcoded beads，每個bead上有40-80萬探針。
技術要點
> 8通道的微流體“雙十字”交叉系統
> 含Barcoded RT Primers的Gel Beads、細胞和酶的混合物、油
> 三者結合形成GEMs，即包裹Gel Beads、細胞和酶的混合物的油滴
> GEMs被收集（單細胞捕獲率≈65%）
技術流程
>GEM形成后，細胞裂解，凝膠珠自動溶解釋放大量barcode序列，隨后mRNA逆轉錄產生帶有Barcode和UMI信息的cDNA。
>油滴破碎，cDNA為模板進行PCR擴增，然后進行cDNA打斷、加測序接頭P5及測序引物R1等傳統二代測序的建庫過程。
>測序后，得到每個細胞的轉錄組表達譜，Barcode標記細胞，UMI標記基因并記錄表達量。
